・見逃し視聴ありでお申込み頂いた方は、セミナーの録画動画を一定期間視聴可能です。
・セミナーを復習したい方、当日の受講が難しい方、期間内であれば動画を何度も視聴できます。
・原則、遅くとも開催4営業日後までに録画動画の配信を開始します（一部、編集加工します）。
・視聴期間はセミナー開催日から4営業日後を起点に1週間となります。
ex) 2/6（月）開催 セミナー → 2/10（金）までに配信開始 → 2/17（金）まで視聴可能
※メールにて視聴用URL・パスワードを配信します。配信開始日を過ぎてもメールが届かない場合は必ず弊社までご連絡ください。
※準備出来しだい配信致しますので開始日が早まる可能性もございます。その場合でも終了日は変わりません。
上記例の場合、2/8（水）から開始となっても2/17まで視聴可能です。
※GWや年末年始・お盆期間等を挟む場合、それに応じて弊社の標準配信期間設定を延長します。
※原則、配信期間の延長は致しません。
※万一、見逃し視聴の提供ができなくなった場合、
（見逃し視聴あり）の方の受講料は（見逃し視聴なし）の受講料に準じますので、ご了承ください。
→見逃し視聴について、
こちらから問題なく視聴できるかご確認ください。（テスト視聴動画へ） パスワード「123456」
セミナーポイント
■講座のポイント
ナノポアシークエンサーは、膜タンパクを通過するDNAの電気シグナルの変化によって塩基配列を読み解く第三世代のシークエンサーであり、1. 手に乗るほど小型で安価であること、2. DNAだけでなくRNAも直接読め、さらに修飾塩基も決定できること、3. 読める長さに制限がなく、数百kbpのDNAが読み取れること、などのユニークな特徴を持つ。当初懸念された精度も近年では99～99.9%程度に向上している。一方、そのデータ解析はこれら特徴からIlluminaなどのシークエンサーとは異なる側面もあるため、本講義では事例と共に、ゲノムアセンブリーやプラスミドシークエンスなどを実践的に解説し、ナノポアシークエンサーデータのデータ解析の基本から応用までを紹介する。
■受講後、習得できること
・ナノポアシークエンスデータ解析の環境構築
・シークエンスデータの前処理・クオリティコントロール方法
・バクテリアゲノムのアセンブリーとアノテーション
・真核生物（非脊椎動物）ゲノムのアセンブリーとアノテーション
・プラスミドシークエンシングの実験手法と解析手法
■本テーマ関連法規・ガイドラインなど
・人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針（厚生労働省）
ただし、本講義ではヒトのデータは扱わないので、各自扱う場合のみ。
■講演中のキーワード
・ナノポアシークエンサー
・ゲノムアセンブリー
・ロングリード
・バクテリアゲノム
・プラスミドシークエンシング
セミナー内容
1. 事例紹介
1.1 ナノポアシークエンスによるクモ糸タンパクの解析及び人工タンパク素材設計
・野外採取のクモ1000種の解析や、Direct RNA-Seqを含む、
長鎖リピート配列で構成されるクモ糸遺伝子の全長配列をナノポアロングリードによって解析した例を取り上げます。
1.2 ナノポアシークエンスによる超微量DNAからの極限環境耐性生物クマムシゲノムの解析
・体長2-300µmの微小動物クマムシから抽出できる超微量DNA (1個体あたり50pg程度) の野外サンプルから
Droplet-MDA法によって全ゲノム決定をした例を取り上げます。
・クマムシ内で働く遺伝子発現ベクターTardiVecと、これを日常的に大量に作成する際に
プラスミド全長シークエンスをナノポアシークエンサーで行う事例についても紹介します。
2. 実践的講義
2.1 ナノポアシークエンスデータ環境整備と前処理
・必要なコンピュータ・ソフトウェア環境
・ベースコール・フィルタリング・クオリティコントロール
2.2 微生物ゲノムシークエンスとアセンブリー・アノテーション (数Mbpを想定)
・ゲノム抽出・ライブラリ作成（簡単に）
・フィルタリング・アセンブリー・ポリッシング
・遺伝子予測とアノテーション
2.3 動物ゲノムシークエンスとアセンブリー・アノテーション （数百Mbp～数Gbpを想定）
・ゲノム抽出・ライブラリ作成（簡単に）
・フィルタリング・アセンブリー・ポリッシング
・遺伝子予測とアノテーション
2.4 サンガーシークエンスを代替するナノポアシークエンスによるプラスミドシークエンシング
・シークエンス手順
・データ解析手順
3. 質疑応答
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