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シングルセルRNA-seqデータ分析とAI創薬セミナー【Pythonによる実践的なデータ処理・解析】

実践から学ぶ Pythonによる
シングルセルRNA-seqデータ分析とAI創薬への展開

<Zoomのよるオンラインセミナー・見逃し配信あり>

■本セミナーの受講形式(会場/Zoom両アイコンある場合は受講形式選択可)

zoom……Zoomオンライン受講

見逃し視聴あり……見逃し視聴選択可


☆データサイエンス・プログラミング初心者の方も大歓迎!(Pythonの基礎から丁寧に解説いたします。)
☆企業の創薬研究でニーズの高いテーマを厳選!(即戦力となる技術習得を目指します。)
☆‘Google Colab’を用いて演習を多数実施!(各自、事前のご用意をお願いしております。)
※演習に関わる準備物につきましては、お申込みいただいた方へ別途ご連絡いたします。

講師

東京科学大学
M&Dデータ科学センター・AIシステム医科学分野
教授 博士(医学)
清水 秀幸 氏


講師紹介

■経歴
2012年 東北大学医学部医学科 卒業
2014年 岩手県立中部病院 初期研修医 修了
2014~2018年 九州大学 医学系学府 博士課程 (中山敬一 教授)
2015~2018年 日本学術振興会特別研究員 (DC1)
2018~2021年 九州大学 生体防御医学研究所 学術研究員のち特任助教 (中山敬一 教授)
2021~2022年 米国Harvard Medical School・Department of Systems Biology・Research Fellow (Prof. Pamela Silver)
2022年~ 東京医科歯科大学 教授 (M&Dデータ科学センターおよび医歯学総合研究科 所属)
2022年~ 科学技術振興機構さきがけ研究者 (兼務)
2024年~ JST次世代AI人材育成プログラム 医歯学系担当 事業統括 (兼務)
2024年~ 東京科学大学 データサイエンス・AI全学教育機構 (兼務)

■専門および得意な分野・研究
・バイオインフォマティクス
・AI創薬
・システム生物学
・分子生物学
・医学

■関連執筆書籍
・Pythonで実践 生命科学データの機械学習 羊土社 (2023/3/31)企画・執筆・監修
・Pythonで体感!医療とAIはじめの一歩 羊土社 (2024/8/20)分担執筆

■本テーマ関連学協会での活動
・日本バイオインフォマティクス学会
・日本分子生物学会
・日本人工知能学会

<その他関連セミナー>
バイオ/再生医療/中分子/新規モダリティ 一覧はこちら


日時・受講料・お申込みフォーム

●日時:2025年5月22日(木) 10:30-16:30 *途中、お昼休みや小休憩を挟みます。

●受講料:
【オンライン受講(見逃し視聴なし)】:1名 50,600円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき39,600円

【オンライン受講(見逃し視聴あり)】:1名 56,100円(税込(消費税10%)、資料付)
*1社2名以上同時申込の場合、1名につき45,100円

学校法人割引:学生、教員のご参加は受講料50%割引。→「セミナー申込要領・手順」を確認ください。

●録音・録画行為は固くお断りいたします。

■ セミナーお申込手順からセミナー当日の主な流れ →


お申込みはこちらから
オンライン受講/見逃視聴なし

オンライン受講/見逃視聴あり

配布資料・講師への質問など

●配布資料はPDFなどのデータで配布いたします。ダウンロード方法などはメールでご案内いたします。
・配布資料に関するご案内は、開催1週前~前日を目安にご連絡いたします。
・準備の都合上、開催1営業日前の12:00までにお申込みをお願いいたします。
 (土、日、祝日は営業日としてカウントしません。)
・セミナー資料の再配布は対応できかねます。必ず期限内にダウンロードください。

●当日、可能な範囲でご質問にお答えします。(全ての質問にお答えできない可能性もございます。何卒ご了承ください。)
●本講座で使用する資料や配信動画は著作物であり、無断での録音・録画・複写・転載・配布・上映・販売などは禁止いたします。
●ご受講に際しご質問・要望などございましたら、下記メールアドレス宛にお問い合わせください。
req@*********(*********にはjohokiko.co.jpを入れてください)

オンラインセミナーご受講に関する各種案内(必ずご確認の上、お申込みください。)

  • PC/タブレット/スマートフォンなど、Zoomが使用できるデバイスをご用意ください。
  • インターネット 回線速度の目安(推奨) 下り:20Mbps以上
  • 開催が近くなりましたら、Zoom入室URL、配布資料、当日の流れなどをメールでご連絡いたします。開催前日(営業日)の12:00までにメールが届かない場合は必ず弊社までご一報ください。
  • ⇒よくある事例として「弊社ドメイン(johokiko.co.jp)のメールがスパム扱いとなっている」「メールアドレスのご記載ミス」などがございます。お申込み後にフォームへご記載いただいたメールアドレスへ自動返信メールを送信しますので、こちらのメールが受信できない場合、弊社からのZoom入室URLや配布資料のご案内メールもお届けすることができなくなってしまいます。予め受信できる設定にお願いいたします。
    ※メールアドレスの記載誤りについては、以下へご連絡お願いいたします。
    req@*********(*********にはjohokiko.co.jpを入れてください)
  • 受講者側のVPN、セキュリティ設定、通信帯域などのネットワーク環境ならびに使用デバイスの不具合については弊社では対応いたしかねますので予めご了承ください。
  • Zoom使用に関する注意事項(クリックして展開)

  • 公式サイトから必ず事前のテストミーティングをお試しください。
  • 確認はこちら
    →Skype/Teams/LINEなど別のミーティングアプリが起動していると、Zoomで音声が聞こえない、カメラ・マイクが使えないなどの事象が起きる可能性がございます。お手数ですが、これらのアプリは閉じた状態にてZoomにご参加ください。
    音声が聞こえない場合の対処例

  • Zoomアプリのインストール、Zoomへのサインアップをせずブラウザからの参加も可能です。
  • 参加方法はこちら
    →一部のブラウザは音声が聞こえないなどの不具合が起きる可能性があります。
    対応ブラウザをご確認の上、必ず事前のテストミーティング をお願いします。
    (iOSやAndroidOS ご利用の場合は、アプリインストールが必須となります)

    申込み時に(見逃し視聴あり)を選択された方は、見逃し視聴が可能です。(クリックして展開)

  • 見逃し視聴ありでお申込みされた方は、セミナーの録画動画を一定期間視聴可能です。
  • セミナーを復習したい方、当日の受講が難しい方、期間内であれば動画を何度も視聴できます。
  • 原則、遅くとも開催4営業日後までに録画動画の配信を開始します(一部、編集加工します)。
  • 視聴期間はセミナー開催日から4営業日後を起点に1週間となります。
  • ex)2/6(月)開催 セミナー → 2/10(金)までに配信開始 → 2/17(金)まで視聴可能
    →見逃し視聴について、 こちらから問題なく視聴できるかご確認ください。(テスト視聴動画へ)パスワード「123456」

    <見逃し視聴ご案内の流れ・配信期間詳細>
  • メールにて視聴用URL・パスワードを配信します。配信開始日を過ぎてもメールが届かない場合は必ず弊社までご連絡ください。
  • 準備出来しだい配信いたしますので開始日が早まる可能性もございます。その場合でも終了日は変わりません。上記例の2/6開催セミナーの場合、2/8から開始となっても2/17まで視聴可能です。
  • GWや年末年始・お盆期間などを挟む場合、それに応じて弊社の標準配信期間設定を延長します。
  • 原則、配信期間の延長はいたしません。
  • 万一、見逃し視聴の提供ができなくなった場合、(見逃し視聴あり)の方の受講料は(見逃し視聴なし)の受講料に準じますので、ご了承ください。
  • セミナーポイント

    ■講座のポイント
     シングルセルRNA-seq解析とAI創薬という、現代の生命科学研究における2つの重要な技術を結びつけた実践的な講座です。プログラミング初心者の方でも理解できるよう、Pythonの基礎から丁寧に解説し、段階的に実データの解析へと進みます。企業の創薬研究でニーズの高いテーマを厳選し、実習を豊富に取り入れることで、実務での即戦力となる技術の習得を目指します。特に、シングルセル解析で得られた細胞タイプ特異的な知見をAI創薬へ展開する方法論を、Google Colabを用いた実践的な演習を通じて学ぶことができます。

    ■受講後、習得できること
    ・シングルセルRNA-seqデータの基本的な解析フローを理解し、Pythonを用いた実践的なデータ処理・解析が行えるようになります。
    ・機械学習(教師あり・なし学習)を用いた細胞タイプの同定や特徴的な遺伝子の抽出方法を習得し、実データへの応用ができるようになります。
    ・創薬研究におけるAI活用の基礎を理解し、化合物-タンパク質相互作用予測や構造活性相関の基本的な解析が実施できるようになります。
    ・シングルセル解析から得られた知見を創薬ターゲット探索へ応用する具体的なワークフローを実践できるようになります。

    ■本テーマ関連法規・ガイドラインなど
    ・「人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針」
    ・「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」
    ・「医薬品の安全性に関する非臨床試験の実施の基準(GLP)」

    ■講演中のキーワード
    ・シングルセルRNA-seq解析(Single-cell RNA-seq analysis)
    ・UMAP次元削減(UMAP dimensionality reduction)
    ・Python機械学習(Python machine learning)
    ・構造活性相関(Structure-Activity Relationship, SAR)
    ・AI創薬(AI drug discovery)

    セミナー内容

    1. はじめに
     1.1 次世代シークエンサー (NGS) 解析とは
     1.2 AI機械学習とは?
     1.3 創薬の流れ
     1.4 シングルセルRNA-seqとAI創薬の現況
     1.5 本講座の到達目標

    2. データサイエンスの基礎
     2.1 Pythonプログラミングの基本文法
     2.2 データ解析用ライブラリの基礎(pandas, numpy)
     2.3 機械学習の基礎概念(教師あり・なし学習)

    3. シングルセルRNA-seqデータ解析の実務
     3.1 データの前処理とクオリティコントロール手法
     3.2 次元削減技術の理論と実装(PCA, UMAP)
     3.3 クラスタリングによる細胞タイプ同定

    4. シングルセル解析から創薬ターゲットの同定
     4.1 細胞タイプ特異的な遺伝子発現パターンの抽出
     4.2 マーカー遺伝子の統計的解析手法
     4.3 パスウェイ解析の理論と実践

    5. 機械学習の創薬への応用
     5.1 化合物表現方法(SMILES, フィンガープリント)
     5.2 化合物-標的タンパク質相互作用予測の基礎と実践
     5.3 構造活性相関の理論と実践

    6. まとめと発展的な話題
     6.1 バイオインフォやAIの医療への応用、医療者の観点から
     6.2 シングルセル解析と創薬の統合アプローチ
     6.3 最新の研究動向と今後の展望
     6.4 質疑応答

    ※本講座は演習をメインとした講座です。Google Colabを使用しますので、Googleアカウントをご用意ください (無料で取得できます)。
     講座を受けるパソコンからGoogle Colaboratory (https://colab.research.google.com/?hl=ja) にアクセスできることをご確認ください。
    ※プログラミングの基礎から解説しますので、初心者の方でも安心してご参加いただけます。


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